脈沖除塵器的清灰工作是一個經常性的工作，每次清灰過程中如果清灰時間過短，那么脈沖除塵器中除塵布袋的粉塵還沒有清除干凈，如果除塵器進行工作那么阻力會很快的增高，起不到清灰的效果。反之如果清灰時間過長的話過度的清灰會使過濾速度增加，粉塵有可能會進入濾布內部造成濾袋的堵塞嚴重的會造成濾袋破損。
　　綜上所述清灰周期、清灰時間與所采取的清灰方式和處理對象的性質等因素有關，所以必須對粉塵性質、含塵濃度等進行了解，并進行必要的考查之后在確定。清灰周期和清灰時間的確定原則，根據不同的清灰方式采用不同的清灰設定，首先要考慮的是能在濾袋上殘留下一次附著層，以確保有效清灰的最少時間，確定清灰周期。使清灰周期盡可能的長，清灰時間短，從而能在經濟的除塵設備阻力條件下運行。
    脈沖除塵器在運行期間，要經常觀察壓差系統，借以判斷是否出現問題。事先應記錄好正常運行時的壓差數值，如發現壓差增高，可能意味著濾袋出現堵塞、粉塵板結，清灰機構失效、灰斗積灰過多等現象。而壓差降低，可能意味著除塵布袋出現破損、脫落，入口側管道堵塞或閥門關閉，箱體或分室之間有泄漏等現象。
脈沖除塵器的清灰要選擇合適的使用參數，這樣才能有效的進行清灰保潔工作。